A diferencia de otras ligas europeas de fútbol, en España, los equipos filiales juegan en el mismo sistema de liga que su equipo matriz en lugar de jugar una competición exclusiva para equipos filiales. Cabe destacar que todos estos equipos base del Almería militan en su máxima categoría respectiva. Desde la creación de la Liga femenina en 1988 y en sus diversos formatos, el equipo ha estado en la máxima categoría del fútbol femenino (excepto entre las temporadas 1990-91 y 1992-93), manteniéndose entre las mejores o, en el peor de los casos, segunda equipacion barcelona en la zona media de la clasificación.